Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
C4BPBP20851 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4BPBP20851 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms