Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP2C9P11712 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms