Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD8BP10966 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD8BP10966 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD8BP10966 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD8BP10966 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD8BP10966 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD8BP10966 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD8BP10966 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD8BP10966 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms