Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCF2P10911 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCF2P10911 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCF2P10911 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCF2P10911 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCF2P10911 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCF2P10911 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCF2P10911 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCF2P10911 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCF2P10911 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCF2P10911 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCF2P10911 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCF2P10911 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCF2P10911 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCF2P10911 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCF2P10911 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms