Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALM1P0DP23 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms