Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC2BP0DI82 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2BP0DI82 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms