Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D2O95562 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms