Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP2O75604 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP2O75604 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP2O75604 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP2O75604 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP2O75604 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP2O75604 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP2O75604 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP2O75604 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP2O75604 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP2O75604 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP2O75604 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP2O75604 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP2O75604 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP2O75604 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP2O75604 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP2O75604 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP2O75604 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms