Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms