Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX15O60248 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms