Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms