Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB3O43889 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CREB3O43889 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms