Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms