Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms