Protein–RNA interactions for Protein: C9JVW0

INAFM1, Putative transmembrane protein INAFM1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INAFM1C9JVW0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
INAFM1C9JVW0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
INAFM1C9JVW0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms