Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms