Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MEIS3P1A6NDR6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MEIS3P1A6NDR6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms