Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF222A6NCQ9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms