Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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