Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ABLIM1-203ENST00000369253 2255 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CACNB4-220ENST00000636129 2283 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MAPK10-255ENST00000641020 2412 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 PGM2L1-201ENST00000298198 8515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 NID2-201ENST00000216286 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CAPN3-201ENST00000318023 3172 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ELP4-218ENST00000639570 5795 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 PIEZO2-204ENST00000538948 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SEC22C-201ENST00000264454 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RNF2-202ENST00000367510 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SKAP1-201ENST00000336915 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 FBXO36-202ENST00000373652 3120 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TCF4-210ENST00000561831 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TIGIT-203ENST00000481065 3710 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TRIM16L-201ENST00000395671 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RSPH10B2-202ENST00000403107 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 HPS1-204ENST00000361490 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CD302-201ENST00000259053 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MYH13-201ENST00000252172 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SLC39A6-201ENST00000269187 3543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TRIM32-201ENST00000373983 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RPSAP21-201ENST00000414293 885 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MIATNB-201ENST00000417083 706 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 NME6-205ENST00000421967 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 LINC01399-201ENST00000423311 648 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 VNN3-206ENST00000423615 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC007163.2-201ENST00000479041 750 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC104164.4-201ENST00000483456 493 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 C5orf67-202ENST00000611197 354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 BCAS3-233ENST00000626960 227 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 NFASC-207ENST00000404907 5447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 LINC00607-204ENST00000423530 2104 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CNBD2-202ENST00000373973 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 GLRA1-201ENST00000274576 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ANKRD20A21P-202ENST00000623715 3588 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 PGM1-201ENST00000371083 2657 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CACNA1C-202ENST00000335762 6968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 EDAR-201ENST00000258443 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 GOSR2-237ENST00000640443 3929 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SYS1-204ENST00000426004 2915 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CDC42SE1-207ENST00000540998 3181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CDC42EP3-206ENST00000611976 5124 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CLEC4M-201ENST00000248228 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CAB39L-202ENST00000355854 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 KDM5D-201ENST00000317961 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 FBXW7-207ENST00000603841 2261 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SERPINB8-202ENST00000353706 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 PNPLA4-201ENST00000381042 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SPECC1-204ENST00000395527 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ABLIM1-201ENST00000277895 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SCMH1-211ENST00000456518 1586 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TCF20-201ENST00000335626 6237 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 COL10A1-202ENST00000327673 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AHCYP5-201ENST00000331585 1238 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 FCER1G-202ENST00000367992 551 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RNA5SP377-201ENST00000390852 112 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RNA5SP376-201ENST00000390949 112 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 FCRL6-204ENST00000392235 947 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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