Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM238A-202ENST00000637359 442 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 GJA5-203ENST00000621517 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ENTHD1-201ENST00000325157 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF44-203ENST00000356109 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP30-202ENST00000368015 3887 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 EFR3B-204ENST00000403714 7434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 WARS2-IT1-201ENST00000423984 2060 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 NPHS1-201ENST00000353632 3741 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF18-205ENST00000580613 2250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 OLFML2B-203ENST00000367940 2685 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC38A7-206ENST00000564100 2867 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HYDIN-209ENST00000538248 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MPI-201ENST00000323744 1619 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF385B-203ENST00000409692 2109 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HHAT-202ENST00000367009 2714 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms