Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 BEND3P2-201ENST00000414425 2254 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXL2NB-201ENST00000383165 3538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CPA4-202ENST00000445470 2718 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 FLNB-203ENST00000419752 2002 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TIAM2-212ENST00000529824 5262 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNE1-204ENST00000367248 7165 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SPEF2-201ENST00000282469 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MYH13-203ENST00000621918 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ABLIM1-201ENST00000277895 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLCO2A1-201ENST00000310926 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PACSIN1-202ENST00000374043 4229 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MGC15885-201ENST00000558940 2425 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR55-201ENST00000358337 4080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MEIS2-211ENST00000559085 2538 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MAGEB10-201ENST00000356790 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ABRAXAS1-201ENST00000321945 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms