Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC007614.1-201ENST00000566607 309 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms