Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR3KQ9Y2Y1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR3KQ9Y2Y1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR3KQ9Y2Y1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR3KQ9Y2Y1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR3KQ9Y2Y1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR3KQ9Y2Y1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR3KQ9Y2Y1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR3KQ9Y2Y1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms