Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms