Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD7AQ9UPZ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THSD7AQ9UPZ6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms