Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1024Q9UPX6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms