Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD1Q9UP38 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD1Q9UP38 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD1Q9UP38 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD1Q9UP38 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD1Q9UP38 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD1Q9UP38 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FZD1Q9UP38 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms