Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX12Q9UMY4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms