Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNRF3Q9ULT6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms