Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms