Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms