Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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