Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms