Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC18Q9NUE0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC18Q9NUE0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC18Q9NUE0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC18Q9NUE0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC18Q9NUE0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms