Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms