Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms