Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHARPINQ9H0F6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms