Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms