Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms