Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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LRRC3Q9BY71 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC3Q9BY71 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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