Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD2Q9BTF0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms