Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP8Q99708 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms