Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms