Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms