Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms