Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SENP8Q96LD8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SENP8Q96LD8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms