Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EP400Q96L91 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EP400Q96L91 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
EP400Q96L91 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EP400Q96L91 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EP400Q96L91 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EP400Q96L91 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EP400Q96L91 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EP400Q96L91 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms