Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms