Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA10Q969M2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms